區(qū)別如下：

合格公司注冊資本認(rèn)購登記制度將在FTZ試行。除了規(guī)定的企業(yè)，認(rèn)購制度將試行其他。實收資本不再注冊，不再提交驗資報告。

自由貿(mào)易試驗區(qū)實行“先許可后許可”的有條件登記制度。取得營業(yè)執(zhí)照從事一般生產(chǎn)經(jīng)營活動；申請其他許可經(jīng)營項目的，在取得營業(yè)執(zhí)照和許可證或者批準(zhǔn)文件后，方可從事經(jīng)營活動。

FTZ試行的企業(yè)年檢制度改為企業(yè)年報公示制度。

在FTZ建立業(yè)務(wù)例外目錄系統(tǒng)。

在FTZ試行新的營業(yè)執(zhí)照樣式。

試行外商投資準(zhǔn)入負(fù)面清單備案制度。

外商投資廣告企業(yè)試行備案制。

在FTZ注冊的公司和在FTZ以外注冊的公司有什么區(qū)別？

自由貿(mào)易試驗區(qū)是有條件的。

公司注冊資本實行認(rèn)繳登記制度，除規(guī)定的企業(yè)外，其余試行認(rèn)繳制度，不再登記實收資本，也不提交驗資報告。

自由貿(mào)易試驗區(qū)實行“先許可后許可”的有條件登記制度。

取得營業(yè)執(zhí)照從事一般生產(chǎn)經(jīng)營活動；申請其他許可經(jīng)營項目的，在取得營業(yè)執(zhí)照和許可證或者批準(zhǔn)文件后，方可從事經(jīng)營活動。

FTZ試行的企業(yè)年檢制度改為企業(yè)年報公示制度。

在FTZ建立業(yè)務(wù)例外目錄系統(tǒng)。

未按規(guī)定期限公布年度報告或未通過注冊地(經(jīng)營場所)取得聯(lián)系的企業(yè)將被列入經(jīng)營異常名錄，并通過市場主體信用信息公示系統(tǒng)向社會公示。

在FTZ試行新的營業(yè)執(zhí)照樣式。

試行外商投資準(zhǔn)入負(fù)面清單備案制度。

除《外商投資準(zhǔn)入特別管理措施清單》(負(fù)面清單)以外的地區(qū)，F(xiàn)TZ外商投資企業(yè)應(yīng)向商務(wù)部門或其授權(quán)單位備案，并向登記機關(guān)申請設(shè)立登記。

外商投資廣告企業(yè)試行備案制。

在FTZ，如果外商投資廣告企業(yè)或外商投資企業(yè)申請增加廣告業(yè)務(wù)，將取消投資者資格和廣告業(yè)務(wù)業(yè)績條件，并取消對投資者設(shè)立和經(jīng)營年限的要求。