區(qū)別如下：

合格公司注冊(cè)資本認(rèn)購(gòu)登記制度將在FTZ試行。除了規(guī)定的企業(yè)，認(rèn)購(gòu)制度將試行其他。實(shí)收資本不再注冊(cè)，不再提交驗(yàn)資報(bào)告。

自由貿(mào)易試驗(yàn)區(qū)實(shí)行“先許可后許可”的有條件登記制度。取得營(yíng)業(yè)執(zhí)照從事一般生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)活動(dòng)；申請(qǐng)其他許可經(jīng)營(yíng)項(xiàng)目的，在取得營(yíng)業(yè)執(zhí)照和許可證或者批準(zhǔn)文件后，方可從事經(jīng)營(yíng)活動(dòng)。

FTZ試行的企業(yè)年檢制度改為企業(yè)年報(bào)公示制度。

在FTZ建立業(yè)務(wù)例外目錄系統(tǒng)。

在FTZ試行新的營(yíng)業(yè)執(zhí)照樣式。

試行外商投資準(zhǔn)入負(fù)面清單備案制度。

外商投資廣告企業(yè)試行備案制。

在FTZ注冊(cè)的公司和在FTZ以外注冊(cè)的公司有什么區(qū)別？

自由貿(mào)易試驗(yàn)區(qū)是有條件的。

公司注冊(cè)資本實(shí)行認(rèn)繳登記制度，除規(guī)定的企業(yè)外，其余試行認(rèn)繳制度，不再登記實(shí)收資本，也不提交驗(yàn)資報(bào)告。

自由貿(mào)易試驗(yàn)區(qū)實(shí)行“先許可后許可”的有條件登記制度。

取得營(yíng)業(yè)執(zhí)照從事一般生產(chǎn)經(jīng)營(yíng)活動(dòng)；申請(qǐng)其他許可經(jīng)營(yíng)項(xiàng)目的，在取得營(yíng)業(yè)執(zhí)照和許可證或者批準(zhǔn)文件后，方可從事經(jīng)營(yíng)活動(dòng)。

FTZ試行的企業(yè)年檢制度改為企業(yè)年報(bào)公示制度。

在FTZ建立業(yè)務(wù)例外目錄系統(tǒng)。

未按規(guī)定期限公布年度報(bào)告或未通過(guò)注冊(cè)地(經(jīng)營(yíng)場(chǎng)所)取得聯(lián)系的企業(yè)將被列入經(jīng)營(yíng)異常名錄，并通過(guò)市場(chǎng)主體信用信息公示系統(tǒng)向社會(huì)公示。

在FTZ試行新的營(yíng)業(yè)執(zhí)照樣式。

試行外商投資準(zhǔn)入負(fù)面清單備案制度。

除《外商投資準(zhǔn)入特別管理措施清單》(負(fù)面清單)以外的地區(qū)，F(xiàn)TZ外商投資企業(yè)應(yīng)向商務(wù)部門(mén)或其授權(quán)單位備案，并向登記機(jī)關(guān)申請(qǐng)?jiān)O(shè)立登記。

外商投資廣告企業(yè)試行備案制。

在FTZ，如果外商投資廣告企業(yè)或外商投資企業(yè)申請(qǐng)?jiān)黾訌V告業(yè)務(wù)，將取消投資者資格和廣告業(yè)務(wù)業(yè)績(jī)條件，并取消對(duì)投資者設(shè)立和經(jīng)營(yíng)年限的要求。